Его основало общественное общество «Черный дождь», члены которого уже много лет собирают уникальные экспонаты, связанные с деятельностью органов госбезопасности. Музей КГБ в Праге – место, где спасенные энтузиастами от уничтожения и захоронения поистине бесценные предметы принадлежали руководителям КГБ, НКВД, ОГПУ, а также первым лицам СССР.
В отдельном зале можно увидеть фотовыставку Праги 1968 года – драматические фотографии, сделанные сотрудниками КГБ, камеры для тайных съемок, агенты, стенды, рассказывающие об истории личного оружия офицеров. Каждый из залов музея воспроизводит атмосферу служебных помещений и кабинетов органов КГБ; здесь можно увидеть практически все, что было неразрывно связано с деятельностью офицеров и рядовых сотрудников советских спецслужб. Часть представленных здесь материалов еще не снята с грифа «Совершенно секретно».
Не многие музеи мира могут похвастаться выставками, включающими в себя такие уникальные экспонаты, как посмертная маска Владимира Ильича Ленина, оружие, из которого был убит Троцкий, оборудование из лабораторий КГБ, личные вещи Берии и значительное количество других не менее редких предметы.