Это монументальное здание было построено в 1656 году как адмиралтейский склад и арсенал по проекту Даниэля Сталперта, известного архитектора того времени, чье имя увековечено во многих архитектурных памятниках Амстердама. В 2007 году музей закрыли на капитальную реконструкцию, где двор бывшего арсенала закрыли открытой конструкцией из стекла и металла, рядом с ней убрали простенки, а все экспонаты систематизировали и разместили в тематических экспозициях в 11 больших залов. Обновленный музей был открыт в 2011 году.
Сейчас в морском порту Амстердама проходят выставки, рассказывающие о 500-летней истории Нидерландов, от золотого века и китобойного промысла до современной жизни. Интереснейшая выставка, посвященная «Золотому веку». Свидетелем великой находки того времени является пришвартованный неподалеку роскошный парусник «Амстердам», некогда принадлежавший Ост-Индской компании. Корабль не вернулся из своего первого рейса в 1749 году, а в 1985-1990 годах для музея была изготовлена его точная копия. Теперь желающие могут подняться на борт и рассмотреть все оборудование и салон поближе.
Среди экспонатов музея обширная коллекция картин, посвященных великим морским сражениям, портреты голландских моряков, а также уникальная коллекция морских карт гениев-картографов XVII века Виллема и Яна Блау. Из примечательных экспонатов здесь хранится экземпляр книги «На Молукках» о первом кругосветном плавании Магеллана, труда Максимилиана Трансильвана, изданной в 1523 г. Также очень интересна богатая коллекция глобусов, навигационных инструментов и трактатов по мореплаванию.
Гордостью музея является самая большая коллекция гребных и парусных лодок, но площадь музея такова, что здесь выставлены и небольшие корабли в натуральную величину. Кроме того, здесь выставлена очень богатая коллекция различных моделей кораблей, рассказывающая об истории кораблестроения от Древнего Рима до наших дней. Для тех, кто не интересуется старым кораблестроением, есть выставка, посвященная современным круизным яхтам и трансокеанским лайнерам.
В музее можно даже сыграть в интерактивную игру, совершить виртуальное путешествие в мир пиратов и морских сражений, боевых трофеев… «Боевые трофеи» можно купить, как обычно, в сувенирной лавке или в ресторане, расположенном на территории Национального морского музея в Амстердаме.